生物有机肥它符合生产、无公害绿色农产品的肥料原则要求。在施用生物有机肥时掌握正确的方法才能达到好的效果。
首先、生物有机肥施入土层不易过深。因为生物有机肥是依靠其活性来分解有机质的，其活性在一定的温度、湿度、透气性、有机物质的条件下才能实现。而施入太深会影响生物肥活性。
其次、生物有机肥施用时也不宜与单一化肥混施。单一化肥因其成分单一，且酸碱程度不同，如果大量施用，势必影响生物有机肥的生物活性。因此，生物有机肥单独施用。
另外、生物有机肥穴施更重要，特别是茄果类蔬菜，重茬现象不可避免。即使补施了一些生物肥、微肥，由于受温度、湿度、透气性、有机质等条件的影响，再加上幼苗根弱的原因，很难快速发挥作用，如果穴施生物有机肥，一方面可快速促进活跃土壤，提高土壤透气性，促进根系快速生长发育；另一方面可缓解因有机肥不腐熟、化肥没分解形成养分的空缺，及时供给根系养分，给根系一个良好的生长环境，促进团根早形成。
生物有机肥是指特定功能微生物与主要以动植物残体为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。
那么施用生物有机肥需要注意哪些问题呢？
1、选用质量合格的微生物肥料。质量低下、有效活菌数达不到规定指标、杂菌含量高或已过有效期的产品不能施用。
2、施用时尽量减少肥料中微生物的死亡。应避免阳光直射菌肥，拌种时应在阴凉处操作，拌种后要及时播种，并立即覆土。一般菌肥不可与有害农药、化肥混合施用。
3、创造适宜的土壤环境。在酸性土壤上施用应中和土壤酸度后再施。土壤过分干燥时，应及时灌浇。大雨过后要及时排除田间积水，提高土壤的通透性。
4、因地制宜推广应用不同的微生物菌肥料。如根瘤菌肥料应在豆科作物上广泛施用，解磷、解钾类微生物肥料应施用于养分潜力较高的土壤。
5、避免开袋后长期不用，要注意密封储存以免菌种流失。开袋后长期不用，其他细菌就可能侵入袋内，使肥料中的微生物菌群发生改变，影响其使用效果。
6、避免在高温干旱条件下使用。微生物肥料中的微生物在高温干旱条件下，生存和繁殖就会受到影响，不能发挥良好的作用。因此，应选择阴天或晴天的傍晚施用，并结合盖土、盖粪、浇水等措施，避免微生物肥料受阳光直射或因水分不足而难以发挥作用。
7、避免与未腐熟的农家肥混用。与未腐熟的有机肥混用，会因高温杀死微生物，影响微生物肥料的发挥。
生物有机肥并不是与所有化肥都能任意混合，有些化肥与生物有机肥混合后肥效反而降低，所以一定要注意。
